Основатель школы Ёсинкан Айкидо, Сиода Годзо, родился 5 сентября 1915 года в Токио, в районе, который ныне называется Синдзюку. “Ёсинкан”, что в переводе означает “Дворец (дом) развития духа”, называлось домашнее додзё отца Сиоды. Позже Сиода Годзо продолжил использовать название “Ёсинкан” в разработанном им искусстве.
23 мая 1932 года Сиода Годзо прибыл в “Уэсиба додзё”. Он был настроен скептически, не смотря на полученные рекомендации. Но после спарринга с Уэсибой решил остаться и быстро стал учи деши. В 1961 году Морихей Уэсиба оценивает заслуги и уровень Сиода Годзо высшей степенью в Айкидо того времени – 9-м Даном.
Вскоре после смерти Морихея в Ёсинкане усиливаются различия с Айкикаем, который возглавляет сын Морихея Уэсибы Киссёмару Уэсиба. Годзо Сиода придерживается эффективных техник Айкидзюдзюцу, которым учил до войны Морихей Уэсиба и не приемлет перехода к “мягкому” Айкидо, что приводит к разлады и отделению стиля Ёсинкан.
В 1989 году при помощи Фрэда Хайенса, Жака Пойе, Марка Беккера, Тсутому Чида, Ясухиса Сиода и Хитоши Накано, Сиода Сенсей начинает работать над созданием Международной Федерации Айкидо Ёсинкан – International Yoshinkai Aikido Federation (IYAF). В 1990-1991 годах IYAF была сформирована.